Để phân tích văn hóa Nhật Bản từ quan điểm nhân học văn hóa có thể trên hai phương pháp.
Một là, phương pháp ghi chép lại những đặc trưng nổi bật khi quan sát từ bên ngoài. Cố gắng xây dựng khung văn hóa Nhật Bản với trung tâm là những khác biệt, dựng nên khung văn hóa từ những đặc điểm văn hóa truyền thống như ikebana, wabi, xấu hổ và tội lỗi,…, từ đó làm rõ đặc trưng văn hóa Nhật Bản.
Hai là, phương pháp tổng hợp phân tích từ tổng thể các yếu tố văn hóa có liên quan với nhau, với trung tâm là các giá trị quan hay cơ cấu xá hội, làm rõ đặc trưng văn hóa Nhật Bản thông qua so sánh các nền văn hóa khác.